甘孜寺是霍尔十三寺之一,霍尔十三寺自建成以后,一直得到了来自霍尔七土司的关照,都得到了很好的发展,且与霍尔诸土司形成了紧密的政教关系。其中甘孜寺与孔萨土司关系*为密切。甘孜寺位于甘孜县城,设有村尼扎仓和昂巴扎仓。
前者是专修显宗的经院,后者则是专修密宗的经院。历史上的住寺僧人曾达3000余人。从寺庙的**权来看,甘孜寺的“更操”(执事),历由孔萨土司和麻书土司各指定二人担任。清末,麻书土司绝嗣后则由孔萨土司*自任命。该寺僧位*高的是香根活佛。历史上的几位香根活佛均出自孔萨家族。从寺庙与土司的日常关系来看,每年藏历1月,甘孜寺都要举行一次大祈祷**。
**期间寺庙每天将收受布施的21%送归孔萨土司。而孔萨土司也会在每年藏历12月28日,向全寺大小喇嘛、扎巴各赠送大园饼一个(重约1斤),作新年慰问。孔萨土司在与官府或其它土司、头人发生纠分时,也多由甘孜寺僧人出面调解。如若发生**冲突,寺庙往往又是孔萨土司**的基干力量。1939年的“甘孜事变”中(甘孜班禅行辕和孔萨土司联合与***24军发生的**冲突),甘孜寺喇嘛就曾组织敢死队,为班禅行辕和孔萨土司冲锋陷阵。甘孜寺与孔萨土司的这种关系对于彼此巩固教权和**都产生了**重大的作用。